莫道克大学下设9个学院，各院都设有多种专业，共有250多门本科、研究生和研究型课程。 

沃尔特爵士莫道克公共政策与国际事务学院 沃尔特爵士莫道克公共政策与国际事务学院开设有国际事务、公共政策与管理、发展研究以及卫生政策与领导领域的研究生学历资格课程。 通过专业的硕士学位课程及其他研究生课程，该院为学生提供独一无二的机会，让他们能够参与重大政策问题、培养批判思考的高级技能、拓宽就业渠道。 

工程与信息技术学院 工程与信息技术学院是一个创新型的学院，开设有工程学、化学、数学与统计学、信息技术、物理和纳米技术、提取冶金、安全科学以及能源研究领域的课程。 该院拥有众多世界一流的设施（如拜耳试验工场）和极其优秀的教职人员，他们注重帮助学生为从事不断发展、充满挑战的行业领域的工作做好准备。 

商务与管理学院 商务与管理学院非常注重管理、银行学、人力资源、反恐怖主义研究、市场营销、经济学、金融、会计、可持续发展以及政治学领域的跨学科研究。 该院不仅为学生讲授在全球商界持续取得成功所需要的基础知识，还通过一流教师和专业人员的不断指导，让学生学习如何将先进的理论知识应用到实际项目中，从而获得宝贵的行业经验。 

人文学院 人文学院开设有创意艺术、媒体与传播、社会科学以及人文学科领域的各种本科和研究生课程。 世界一流的研究和最优秀的教学人员是该院学科领域不可或缺的一部分。该院的课程侧重国际化，配以一系列最先进的设施以及行业经验，帮助学生在其所选择的专业领域不断取得进步。 

健康专业学院 健康专业学院开设有护理、脊椎按摩疗法、咨询以及医疗保健管理等学科领域的课程，能够为希望从事这些领域工作的学生提供西澳大利亚州最优质的学习和发展资源，该院也因此而倍感自豪。 

心理学与运动科学学院 心理学与运动科学学院开设有心理学、运动生理学以及运动科学领域一系列受到评鉴机构认可的课程，致力于帮助学生为从事心理和身体健康领域的工作做好准备。 

教育学院 教育学院提供优质的中学、小学和幼儿教师职前教育课程，还面向教师和其他部门的教育工作者开设有研究生课程。 教育学院是莫道克大学创建之初就建立的学院之一，目前，该院凭借一系列开创性的教学计划而在该领域处于领先地位。莫道克大学是澳大利亚第一所提供 SimLab 的大学。SimLab是一门混合现实课堂课程，旨在帮助教育专业的学生为从事实际学校工作做好准备。 

法学院 法学院因优质的法律教育而闻名，开设有法律、商法和犯罪学领域的课程，可帮助学生为从事法律工作做好准备。该院是西澳大利亚首屈一指的本科法学院，拥有世界一流的学习环境，致力于提供优质的法律教育和实践。 

兽医与生命科学学院 兽医与生命科学学院开设的课程涉及微生物、动物、植物、化学过程、环境以及人类和动植物健康与疾病的分子基础。 该院的兽医课程受到国际认可，拥有一座正在运营中的一流动物医院，目前部分研究工作在全球农业领域处于领先地位。