商学院
曼彻斯特商学院（简称Alliance MBS）是英国最早建立的两所商学院之一。经过50年的发展，曼彻斯特商学院已成为一所享誉世界的商学院，为英国最优秀的商学院之一。2014年英国研究卓越框架（REF）结果显示，曼彻斯特商学院在商业与管理学领域的“科研力量”（Research Power）位居全英第二。 
 根据2017年英国金融时报全球商学院MBA排名，曼彻斯特商学院位列英国第3名，欧洲第10名，世界第30名   。2014年和2015年金融时报将曼彻斯特商学院的博士课程评为世界第三（2011-2013连续三年世界第一）。根据2015年福布斯（Forbes）杂志最佳国际（非美国）两年制MBA排名，曼彻斯特商学院位列世界第6名。 
曼彻斯特商学院是欧洲商学院的先驱之一，已培养众多优秀商业、金融业领袖，人才辈出。曼彻斯特商学院所创的“Manchester Method”（曼彻斯特项目教学法）在世界管理学上与哈佛商学院的“案例教学法”同享盛名。英国政府机构英格兰高等教育拨款委员会（HEFCE）将曼彻斯特商学院的教学能力评定为最高等级“优秀”。其学历更获“三连冠”——世界三大顶级学术认证机构（AMBA、EQUIS、AACSB）认证。  
根据英国官方科研水平评估（RAE），曼彻斯特商学院的会计与金融系是全英仅有的两个六星级会计与金融系之一，也是英国唯一被官方承认为六星级的独立的会计与金融团队（注：六星级是指连续两次在官方科研评估中获得最高分5*）。   会计与金融（Accounting and Finance）期刊则将曼大的会计金融研究评为世界第一。 曼大在2015QS世界大学会计与金融学科排名上名列世界第18位。  曼彻斯特商学院的会计金融课程得到特许公认会计师公会（ACCA）、特许管理会计师公会（CIMA）、英格兰及威尔士特许会计师协会（ICAEW）等权威机构的认证。  同时，曼彻斯特商学院也是特许金融分析师（CFA）协会的认证合作伙伴。 曼彻斯特商学院的会计与金融系还是欧洲首家被欧盟认可注册为“居里夫人”早期培养博士研究点的同类机构。 

曼彻斯特商学院还是全球高水平商学院合作平台PIM的三所英国成员院校之一。PIM的各成员机构代表了在企业管理和经营领域的最高水平，并在其所在国家或地区处于领导地位。中国大陆的PIM成员院校为北京大学光华管理学院、清华大学经济管理学院、复旦大学管理学院和中欧国际工商学院。  
法学院
曼彻斯特大学法学院创办于1872年，是英国领先的法学院，并享有很高的国际声誉。学院的许多学者与包括联合国、世贸组织在内的许多海外组织有着研究联系。英格兰高等教育拨款委员会（HEFCE）将曼大法学院的教学评定为“优秀”。曼大法学院还是中国政法大学中欧法学院的合作建设者之一。  
社会科学学院
曼彻斯特大学社会科学学院是国际公认的卓越研究和教学中心，围绕经济学、政治学、哲学、社会人类学、社会统计学和社会学。   2014年英国研究卓越框架（REF）结果显示，曼大的社会科学研究位居全英第3位。其中，93%的研究影响被评为最高等级4*（世界领先）或3*（国际优秀），100%的研究环境被评为最高等级4*（世界领先）或3*（国际优秀）。社会学（含社会统计学）被评为最高等级4*（世界领先）的研究活动比例位居全英第一，社会人类学的研究质量在社会人类学系中位居全英第一。经济学和政治学的科研力量均位居全英前十。 
曼大的经济系成立于1854年，是全英最古老的经济学研究中心之一。1866至1876年间，著名经济学家和逻辑学家威廉姆·斯坦利·杰文斯（William Stanley Jevons）在曼大担任政治经济学主席，并在此出版了著作《政治经济学理论》（The Theory of Political Economy），他在书中提出了价值的边际效用理论。1959年英国第一个计量经济学部在曼大成立。  迄今已有3位诺贝尔经济学奖得主在曼大工作过。曼大经济系在2015QS世界大学学科排名上名列全英前十，世界前一百。   曼大90%的经济学毕业生在毕业后的六个月内成功就业，且毕业生薪水位居全英前十。  
曼大的社会人类学系是全英最顶尖的人类学系之一，由英国人类学史上最为重要的人类学家之一马克斯·格拉克曼（Max Gluckman）创办。曼彻斯特学派是人类学界对英国曼彻斯特大学人类学系以格拉克曼（M. Gluckman）为代表的人类学家群体的称谓。该学派于20世纪40年代末开始崛起，在20世纪60年代达到鼎盛，与伦敦政治经济学院、牛津大学、剑桥大学的人类学家共同创造了英国社会人类学的黄金时代。   许多领先的人类学家都曾在这里工作，例如玛丽莲·斯特拉森（Marilyn Strathern）和蒂姆·英戈尔德（Tim Ingold）。作为全英第一个教授影视人类学的部门，曼大社会人类学系也因在民族志影片制作方面世界领先的培养而闻名。 
环境、教育与发展学院
曼彻斯特大学环境、教育与发展学院（SEED）是国际公认的卓越研究和教学中心，核心目标是理解和改善社会、经济和环境之间的不平衡关系。   2004年，曼大的发展政策与管理研究所（IDPM）与建筑、地理和规划与景观学科联合成立了环境与发展学院，作为新合并而成的曼彻斯特大学的一部分。   2012-13年，曼大的教育学院更名为曼彻斯特教育研究所（MIE），随后和环境与发展学院合并组成如今的环境、教育与发展学院。
曼大的发展政策与管理研究所（IDPM）成立于1958年，是英国大学中最大的专注于国际发展的硕士中心，也是国际发展领域世界领先的研究中心之一。IDPM致力于解决一些当今最紧迫和最直接的全球性问题，包括贫穷、社会排斥、经济移民、新兴经济体和发展政治。   英国官方科研水平评估（RAE 2008）结果显示，IDPM在发展研究（Development Studies）领域的“科研力量”名列全英第一。   曼大在2015QS世界大学发展研究学科排名上名列世界第3位。  2016年，IDPM与布鲁克斯世界贫困研究所（BWPI）合并组成全球发展研究院（GDI）。
曼彻斯特教育研究所（MIE）始建于1890年，在教育研究与教学上拥有长期的卓越声誉。   MIE的所有科目都在英国高等教育质量保证局（QAA）和英国教育标准局（OFSTED）的教学质量评估中被评为“优秀”。  
曼大的地理系拥有120多年历史   ，是世界上最古老和最好的地理部门之一，在2015QS世界大学地理学科排名上名列世界第10位。曼大的地理教学被英国高等教育质量保证局（QAA）评为“优秀”。 
曼大的规划与环境管理系是英国历史最悠久、规模最大的获得专业认证的规划系之一，以卓越的教学和高品质的研究享誉国际。这里的大多数课程获得英国皇家城镇规划学会（RTPI）或英国皇家特许测量师学会（RICS）的专业认证。 
材料学院
曼彻斯特大学材料学院是欧洲最大的材料工程学院，也是欧洲最大的材料科学、时装与纺织研究和教学中心，在材料学领域的“科研力量”位居全英第一。学院的所有材料科学课程均获得英国材料、矿物和采矿学会（IOM3）的认证，纺织和时装设计商业课程获得英国纺织学会（The Textile Institute）的认证。  学院拥有装备精良的实验室、教室和先进的科研设备，同时曼大图书馆藏有世界上最多的纺织书籍。学院与相关产业单位建有紧密联系，确保学生的学位被雇主高度重视。 
基于在金属材料科学与工程研究领域的国际声誉，曼大与谢菲尔德大学于2009年从英国工程和物理科学研究理事会（EPSRC）获得630万英镑投资，联合建立了先进金属系统博士培养中心（CDT）。   曼大的腐蚀与防护中心是世界上最大的专注于腐蚀及其控制的学术基地之一，拥有约700万英镑来自英国工程和物理科学研究理事会、欧盟委员会、英国石油公司、阿克苏诺贝尔、劳斯莱斯、BAE系统公司等机构和企业的资金。  
2014年12月3日，英国财政大臣乔治·奥斯本在其《秋季预算报告》中宣布，英国政府将向曼彻斯特材料科学研究中心拨款2.35亿英镑，建立“亨利·莱斯爵士材料研究所”（Sir Henry Royce Institute for Materials Research and Innovation），以促进英国在先进材料科学领域的研究。 
化学工程学院
曼彻斯特大学化学工程学院是英国最大的化学工程学院。   这里也是世界化学工程学科的诞生地，1887年乔治·戴维斯（George Davis）在此编写了世界上第一本化学工程教科书。  曼大的化工从开创以来一直都是英国乃至世界的顶尖专业，2014年英国研究卓越框架（REF）排名全英TOP3，90%的研究被评为最高等级4*（世界领先）或3*（国际优秀）。   曼大在2015QS世界大学化学工程学科排名上名列世界第25位（英国第4位，仅次于剑桥、帝国理工和牛津）。   学院的所有课程都得到英国化学工程师协会（IChemE）认证。  学院大楼James Chadwick Building内配备了一系列大型工业加工设备，是欧洲规模最大、功能最完备的化工学院大楼之一。  
计算机科学学院
曼彻斯特大学计算机科学学院的历史可以追溯到1946年，学院正式成立于1964年，是英国最早的计算机学院之一。在这里诞生了许多世界第一，包括第一台可存储程序计算机、第一台浮点机、第一台晶体管计算机和第一台使用虚拟存储器的计算机。计算机科学之父阿兰·图灵（Alan Turing）于1948-1954年在曼大工作，并领导了曼彻斯特马克一号（Manchester Mark 1）电脑的系统开发工作。
2014年英国研究卓越框架（REF）结果显示，曼大在计算机科学与信息学领域的研究质量位居全英第4位，94%的研究被评为最高等级4*（世界领先）或3*（国际优秀）。其中，研究环境位居全英第一，研究影响并列全英第一。   曼大在2015QS世界大学计算科学与信息系统学科排名上名列世界第48位   ，在2015US News世界大学计算机科学学科排名上名列世界第52位   。
最近的英格兰高等教育拨款委员会（HEFCE）教学评估将曼大计算机专业评定为最高等级“优秀”。这里的所有单荣誉（Single Honours）学位课程均获得国际工程技术学会（IET）和英国计算机协会（BCS）的完全认证。  曼大计算机科学学院拥有唯一由英国工程和物理科学研究理事会（EPSRC）资助的计算机科学博士培养中心（CDT）。   此外，学院与IBM、谷歌、微软、艺电等行业巨头都建有密切的合作伙伴关系。 
医学院
曼彻斯特医学院正式成立于1874年，是英国最大的医学院。在英国，问题导向学习（Problem-based learning, PBL）最早由曼彻斯特大学于1994年引入英国医学教育系统，现已成为除牛津和剑桥两个医学院之外英国各大医学院的主流教育方法。在最近的教学质量审查中，该院是全英仅有的四所获得最高评分的医学院之一。2016年8月，曼彻斯特医学院整并入重组而成的生物、医学与健康院系下的医学科学学院。